Náttúrufræðingurinn

Årgang

Náttúrufræðingurinn - 2004, Side 44

Náttúrufræðingurinn - 2004, Side 44
Náttúrufræðingurinn tímum í sögu lífsins þegar prótíns- míð hófst og DNA tók við af RNA. RNA-eftirmyndun þeirra kann að vera leif frá þeim tímum. RÍBÓSÍM Ekkert hefur orðið hugmyndum um RNA-skeiðið í sögu lífsins meir til framdráttar en fundur RNA-sam- einda með hvötunarvirkni, þ.e. ríbósíma, í nútímafrumum. Það var snemma á áttunda áratugi tuttug- ustu aldar að fyrstu ríbósímin fund- ust. Annars vegar sýndi Thomas R. Cech (4. mynd) fram á að brottnám innraða úr forverum rRNA-sam- einda í frumdýrinu Tetrahymena ther- mophila er hvatað af rRNA-sam- eindinni sjálfri án aðstoðar prótína.10 Hvötunarvirknin er tengd innröð- inni. Hins vegar sannaði Sidney Altman (5. mynd) að RNA-sameind er nauðsynlegur hluti ensíms sem snyrtir forverasameindir allra tRNA-sameinda með því að rjúfa tvíestertengi á alveg ákveðnum stað í forveranum.11 Ensímið er sett saman úr RNA og prótíni en í ljós kom að hvötunarvirknin er tengd RNA-hlutanum. Hér er því um ríbósím að ræða. Þetta efnahvarf er öllum lífverum nauðsynlegt. Það á vitanlega líka við um hvötunar- virkni ríbósómanna sem áður var nefnd. Ríbósómin eru ríbósím. snRNA-sameindir splæsikornanna, sem eins og fyrr var sagt mega lík- lega teljast til ríbósíma, eru líka ómissandi. Hlutverkin sem ríbósím gegna í nútímafrumum eru ekki mörg eða fjölbreytt en þau eru afar mikilvæg.12 Á hinn bóginn hefur mönnum tekist með öflugum val- aðferðum að fá fram í tilrauna- glösum ríbósím sem sýna mun fjöl- skrúðugri virkni. Sem dæmi má nefna hvötun amíðtengja og tengja milli tveggja kolefnisatóma. Einnig er athyglisvert að fram hefur komið ríbósím sem hvatar myndun kirnis- leifar úr ríbósa og pýrimídínbasa.13 RNA-skeiðið Gerum nú ráð fyrir að RNA hafi á ákveðnu stigi snemma í þróunar- 4. mynd. Thomas R. Cech (f. 1947). sögu lífsins verið eina erfðaefnið og reynum að gera okkur grein fyrir helstu eiginleikum þeirra lífvísa - sumir mundu segja lífvera - sem þá voru til. Ætlað er að á þeim tíma hafi RNA ekki einungis verið erfðaefni heldur hafi RNA-sameindir líka hvatað flest efnahvörf frumunnar sem þurftu hvötunar við. Eiginleg prótín hafa ekki verið til, en ekki er útilokað að einstakar amínósýrur eða jafnvel stuttar peptíðkeðjur hafi komið við sögu. Hugsanlegt er að ríbósím líf- vísisins hafi getað tengt amínósýrur í peptíðkeðjur og er líklegast að amínósýruröðin hafi þá verið til- viljunarkennd. Fjöldi mismunandi tiltækra amínósýra hefur þó að lík- indum verið takmarkaður. Einstakar amínósýrur eða stuttar peptíðkeðjur gætu hafa verið gagnlegar sem hjálparþættir ríbósíma.14 Lífvísirinn hlýtur að hafa verið umlukinn himnu sem sennilega hefur verið gerð úr fitusameindum líkt og himnur nútímafrumna. Án himnu má telja útilokað að efna- skipti gætu hafa haldist við. En hversu margbrotinn getur þessi RNA-lífvísir hafa verið? Hve umfangsmikið var erfðaefnið, hversu fjölbreytileg var hvötunar- virkni RNA-sameinda og hve fjöl- skrúðug voru efnaskiptin? Sér- fræðinga greinir mjög á um svör við þessum spumingum. Þótt hlutverk ríbósíma í nútíma- 5. mynd. Sidney Altman (f. 1939). fmmum sé fábreytilegt, þykir mynd- un nýrra ríbósíma á tilraunastofum sýna að hlutverk þeirra gætu hafa verið mun fjölbreyttari fyrr á tímum.15 Einnig er hugsanlegt að efnaskipti lífvísisins hafi að ein- hverju leyti treyst á óhvötuð efnahvörf16 og loks er mögulegt að ýmis nauðsynleg lífefni hafi fengist úr umhverfinu. Er þá farið að gera ráð fyrir ófmmbjarga lífvísi, en um þann kost var rætt í fyrri grein.1 Flestar nútímafmmur hafa þús- undir gena en til em bakteríur sem hafa aðeins nokkur hundmð gen. Minnsta genamengið sem hefur verið raðgreint er úr bakteríunni Mycoplasma genitalium. í genamengi hennar em aðeins um 480 gen.17 Þessi baktería lifir sníkjulífi og kemst þannig hjá því að framleiða sjálf flestar þær smásameindir sem hún þarf þó á að halda. Með hliðsjón af genaþörf þessarar og annarra genafárra tegunda hefur verið komist að þeirri niðurstöðu að lág- marksfjöldi gena í fmmu með nútí- maskipulagi sé um 260 gen.18 Af þessum 260 genum em um 100 sem þarf til þess að gera prótínmyndun- arkerfið úr garði og um 20 sem nauðsynleg em fyrir eftirmyndun DNA. Þessara gena var augljóslega ekki þörf á RNA-skeiðinu. Þá em eftir um 140 lífsnauðsynleg gen, en mjög ólíklegt er að gen RNA-líf- vísisins hafi verið svo mörg. Hugsanlega hafa sumar RNA- 42

x

Náttúrufræðingurinn

Direkte link

Hvis du vil linke til denne avis/magasin, skal du bruge disse links:

Link til denne avis/magasin: Náttúrufræðingurinn
https://timarit.is/publication/337

Link til dette eksemplar:

Link til denne side:

Link til denne artikel:

Venligst ikke link direkte til billeder eller PDfs på Timarit.is, da sådanne webadresser kan ændres uden advarsel. Brug venligst de angivne webadresser for at linke til sitet.