Náttúrufræðingurinn

Árgangur

Náttúrufræðingurinn - 2013, Blaðsíða 32

Náttúrufræðingurinn - 2013, Blaðsíða 32
Náttúrufræðingurinn 140 Þakkir Höfundar vilja þakka eftirtöldum aðilum fyrir veitta aðstoð við verkefnið: Guðbjörgu Gunnarsdóttur þjóðgarðsverði og landvörðum í Þjóðgarðinum Snæfellsjökli þökkum við ráðgjöf, leiðsögn og aðstoð við val sýnatökustaða, Árna B. Stefánssyni þökkum við fyrir afnot af uppdrætti (3. mynd), Agli B. Thorstensen, Árnýju I. Brynjarsdóttur og Dönu R. Jónsdóttur þökkum við veitta tækniaðstoð við sýnatöku og ýmsa rannsóknavinnu, Nátt- úruverndarsjóði Pálma Jónssonar og Háskólasjóði KEA þökkum við veittan stuðning við verkefnið. Heimildir 1. Moya, M., Garcia, M.G., Spilde, M.N. & Northup, D.E. 2009. Composi- tion of bacterial mats in El Malpais National Monument, New Mexico, USA: Comparison and contrasts with bacterial communities in Hawai’i lava tubes. Bls. 709–713 í: Proceedings of the 15th International Congress of Speleology (ritstj.: White, W.B.). Greyhound Press, London. 2. Northup, D.E., Melim, L.A., Spilde, M.N., Hathaway, J.J.M., Garcia, M.G. & Moya, M. 2011. Lava cave microbial communities within mats and sec- ondary mineral deposits: implications for life detection on other planets. Astrobiology 11. 601–618. 3. Leveille, R.J., Longstaffe, F.J. & Fyfe, W.S. 2002. Kerolite in carbonate-rich speleothems and microbial deposits from basaltic caves, Kauai, Hawaii. Clays and Clay Minerals 50. 514–524. 4. Melim, L.A., Northup, D.E., Spilde, M.N., Jones, B., Boston, P.J. & Bixby, R.J. 2008. Reticulated filaments in cave pool speleothems: microbe or mineral? Journal of Cave and Karst Studies 70. 135–141. 5. Ríos, A.d.l., Bustillo, M.A., Ascaso, C. & Carvalho, M.R. 2011. Biocon- structions in ochreous speleothems from lava tubes on Terceira Island (Azores). Sedimentary Geology 236. 117–128. 6. Engel, A.S. 2010. Microbial diversity of cave ecosystems. Bls. 219–238 í: Geomicrobiology: Molecular and Environmental Perspective (ritstj. Bar- ton, L.L., Mandl, M. & Loy, A.). Springer, Berlín. 7. Sarbu, S.M., Kane, T.C. & Kinkle, B.K. 1996. A chemoautotrophically based cave ecosystem. Science 272. 1953–1955. 8. Lavoie, K.H. & Northup, D.E. 2005. Bacteria as indicators of human impact in caves. Bls. 40–47 í: 2005 National Cave and Karst Management Symposium. National Cave and Karst Management Symposia. 9. Groth, I., Vettermann, R., Schuetze, B., Schumann, P. & Saiz-Jimenez, C. 1999. Actinomycetes in Karstic caves of northern Spain (Altamira and Tito Bustillo). Journal of Microbiological Methods 36. 115–122. 10. Somavilla, J.F., Khayyat, N. & Arroyo, V. 1978. A comparative study of microorganisms present in the Altamira and La Pasiega cave. Interna- tional Biodeterioration Bulletin 14. 103–109. 11. Groth, I.I., Schumann, P.P., Laiz, L.L., Sanchez-Moral, S.S., Cañveras, J.C. & Saiz-Jimenez, C.C. 2001. Geomicrobiological Study of the Grotta dei Cervi, Porto Badisco, Italy. Geomicrobiology Journal 18. 241–258. 12. Eisenlord, S.D. & Zak, D.R. 2010. Simulated Atmospheric Nitrogen Depo- sition Alters Actinobacterial Community Composition in Forest Soils. Soil Science Society of America Journal 74. 1157–1166. 13. Saez, J.M., Benimeli, C.S. & Amoroso, M.J. 2012. Lindane removal by pure and mixed cultures of immobilized actinobacteria. Chemosphere 89. 982–987. 14. Okami, Y. & Hotta, K. 1998. Search and discovery of new antibiotics. Bls. 33–67 í: Actinomycetes in Biotechnology (ritstj.: Goodfellow, M. & Williams, S.T.). Academic Press Ltd., London. 15. Kay, S., Pathom-aree, W. & Cheeptham, N. 2013. Screening of volcanic cave actinomycetes for antimicrobial activity against Paenibacillus larvae, a honey bee pathogen. Chiang Mai Journal of Science 40. 26–33. 16. María Markúsdóttir, Starri Heiðmarsson, Arnheiður Eyþórsdóttir, Kristinn P. Magnússon & Oddur Vilhelmsson 2013. The natural and anthropogenic microbiota of Glerá, a sub-Arctic river in northeastern Iceland. International Biodeterioration and Biodegradation 84. 192–203. 17. Jón P. Jóelsson, Heiða B. Friðjónsdóttir & Oddur Vilhelmsson 2013. Bio- prospecting a glacial river in Iceland for bacterial biopolymer degrad- ers. Cold Regions Science and Technology 96. 86–95. Doi: 10.1016/j. coldregions.2013.03.001. 18. Tamura, K., Peterson, D., Peterson, N., Stecher, G., Nei, M. & Kumar, S. 2011. MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis using Maxi- mum Likelihood, Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods. Molecular Biology and Evolution 28. 2731–2739. 19. Edgar, R.C. 2004. MUSCLE: multiple sequence alignment with high accuracy and high throughput. Nucleic Acids Research 32. 1792–1797. 20. Saitou, N. & Nei, M. 1987. The neighbor-joining method: A new method for reconstructing phylogenetic trees. Molecular Biology and Evolution 4. 406–425. 21. Nei, M., & Kumar, S. 2000. Molecular Evolution and Phylogenetics. Oxford University Press, New York. 333 bls. 22. Felsenstein, J. 1985. Confidence limits on phylogenies: An approach using the bootstrap. Evolution 39. 783–791. 23. Tindall, B.J. Sikorski, J. Smibert, R.A. & Krieg, N.R. 2007. Phenotypic characterization and the principles of comparative systematics. Bls. 330– 393 í: Methods for General and Molecular MicrobiologyReddy, C.A. (ed.). ASM Press, Washington D. C. 24. Oddur Vilhelmsson 2000. Specific solute effects in Staphylococcus aureus: an investigation into growth, compatible solute uptake, and membrane protein expression patterns in response to humectant identity. Ph.D. rit- gerð. The Pennsylvania State University, State College, PA. 25. Nautiyal, C.S. 1999. An efficient microbiological growth medium for screening phosphate solubilizing microorganisms. FEMS Microbiology Letters 170. 265–270. 26. Silverman, M.P. & Lundgren, D.G. 1959. Studies on the chemoauto- trophic iron bacterium Ferroobacillus ferrooxidans. Journal of Bacteriology 77. 642–647. 27. Garcia, M.G., Moya, M., Spilde, M.N., Stone, F.D. & Northup, D.E. 2009. Discovering new diversity in Hawaiian lava tube microbial mats. Bls. 364–369 í: Proceedings of the 15th International Congress of Speleology (ritstj.: White, W.B.). Greyhound Press, London. 28. Northup, D.E., Connolly, C.A., Trent, A., Peck, V.M., Spilde, M.N., Wel- bourn, W.C. & Natvig, D.O. 2004. The nature of bacterial communities in Four Windows Cave, El Malpais National Monument, New Mexico, USA. AMCS Bulletin 19. 119–125. 29. Goodfellow, M. & Minnikin, D.E. 1977. Nocardioform Bacteria. Annual Review of Microbiology 31. 159–180. 30. Yoon, J.-H. & Park, Y.-H. 2006. The Genus Nocardioides. Prokaryotes 3. 1099–1113. 31. Stackebrandt, E. & Schumann, P. 2006. Introduction to the taxonomy of Actinobacteria. Prokaryotes 3. 297–321. 32. Prauser, H. 1976. New nocardioform organisms and their relationship. Bls. 193–207 í: Actinomycetes: The Boundary Microorganisms (ritstj. Arai, T.). Toppan Co., Tokyo. 33. Quintana, E., Badillo, R. & Maldonado, L. 2013. Characterisation of the first actinobacterial group isolated from a Mexican extremophile environ- ment. Antonie Van Leeuwenhoek 104. 63–70. 34. Jurado, V., Boiron, P., Kroppenstedt, R.M., Laurent, F., Couble, A., Laiz, L., Klenk, H., González, J.M., Saiz-Jimenez, C., Mouniée, D., Bergeron, E. & Rodríguez-Nava, V. 2008. Nocardia altamirensis sp. nov., isolated from Altamira cave, Cantabria, Spain. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 58. 2210–2214. 35. Seo, J.P., Yun, Y. & Lee, S.D. 2007. Nocardia speluncae sp. nov., isolated from a cave. International Journal of Systematic and Evolutionary Micro- biology 57. 2932–2935. 36. Barton, H.A., Taylor, N.M., Kreate, M.P., Springer, A.C., Oehrle, S.A. & Bertog, J.L. 2007. The impact of host rock geochemistry on bacterial community structure in oligotrophic cave environments. International Journal of Speleology 36. 93–104. 37. Brown-Elliott, B.A., Brown, J.M., Conville, P.S. & Wallace, R.J. April 2006. Clinical and laboratory features of the Nocardia spp. based on current molecular taxonomy. Clinical Microbiology Reviews 19. 259–282. 38. Euzéby, J.P. 2013. List of Prokaryotic names with Standing in Nomencla- ture, http://www.bacterio.cict.fr (skoðað 28. ágúst 2013). 39. Lee, S.D. 2006. Nocardia jejuensis sp. nov., a novel actinomycete isolated from a natural cave on Jeju Island, Republic of Korea. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 56. 559–562. 40. Kämpfer, P., Huber, B., Buczolits, S., Thummes, K., Grün-Wollny, I. & Busse, H. 2007. Nocardia acidivorans sp. nov., isolated from soil of the island of Stromboli. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 57. 1183–1187. 41. Saintpierre-Bonaccio, D., Maldonado, L.A., Amir, H., Pineau, R. & Good- fellow, M. 2004. Nocardia neocaledoniensis sp. nov., a novel actinomycete isolated from a New-Caledonian brown hypermagnesian ultramafic soil. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 54. 599–603. 42. Urzì, C., De Leo, F. & Schumann, P. 2008. Kribbella catacumbae sp. nov. and Kribbella sancticallisti sp. nov., isolated from whitish-grey patinas in the catacombs of St Callistus in Rome, Italy. International Journal of System- atic and Evolutionary Microbiology 58. 2090–2097. 43. De Leo, F., Iero, A., Zammit, G. & Urzì, C. 2012. Chemoorganotrophic bacteria isolated from biodeteriorated surfaces in cave and catacombs. International Journal of Speleology 41. 125–136. 44. Carlsohn, M.R., Groth, I., Spröer, C., Schütze, B., Saluz, H., Munder, T. & Stackebrandt, E. 2007. Kribbella aluminosa sp. nov., isolated from a medieval alum slate mine. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 57. 1943–1947. 45. Li, W., Wang, D., Zhang, Y., Xu, L. & Jiang, C. 2006. Kribbella yun- nanensis sp. nov., Kribbella alba sp. nov., two novel species of genus Kribbella isolated from soils in Yunnan, China. Systematic and Applied Microbiology 29. 29–35. 46. Xu, Z., Xu, Q., Zheng, Z. & Huang, Y. 2012. Kribbella amoyensis sp. nov., isolated from rhizosphere soil of a pharmaceutical plant, Typhonium giganteum Engl. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 62. 1081–1085. 47. Li, W., Wang, D., Zhang, Y., Schumann, P., Stackebrandt, E., Xu, L. & Jiang, C. 2004. Kribbella antibiotica sp. nov., a novel nocardioform actinomycete strain isolated from soil in Yunnan, China. Systematic and Applied Microbiology 27. 160–165.
Blaðsíða 1
Blaðsíða 2
Blaðsíða 3
Blaðsíða 4
Blaðsíða 5
Blaðsíða 6
Blaðsíða 7
Blaðsíða 8
Blaðsíða 9
Blaðsíða 10
Blaðsíða 11
Blaðsíða 12
Blaðsíða 13
Blaðsíða 14
Blaðsíða 15
Blaðsíða 16
Blaðsíða 17
Blaðsíða 18
Blaðsíða 19
Blaðsíða 20
Blaðsíða 21
Blaðsíða 22
Blaðsíða 23
Blaðsíða 24
Blaðsíða 25
Blaðsíða 26
Blaðsíða 27
Blaðsíða 28
Blaðsíða 29
Blaðsíða 30
Blaðsíða 31
Blaðsíða 32
Blaðsíða 33
Blaðsíða 34
Blaðsíða 35
Blaðsíða 36
Blaðsíða 37
Blaðsíða 38
Blaðsíða 39
Blaðsíða 40
Blaðsíða 41
Blaðsíða 42
Blaðsíða 43
Blaðsíða 44
Blaðsíða 45
Blaðsíða 46
Blaðsíða 47
Blaðsíða 48
Blaðsíða 49
Blaðsíða 50
Blaðsíða 51
Blaðsíða 52
Blaðsíða 53
Blaðsíða 54
Blaðsíða 55
Blaðsíða 56
Blaðsíða 57
Blaðsíða 58
Blaðsíða 59
Blaðsíða 60
Blaðsíða 61
Blaðsíða 62
Blaðsíða 63
Blaðsíða 64
Blaðsíða 65
Blaðsíða 66
Blaðsíða 67
Blaðsíða 68
Blaðsíða 69
Blaðsíða 70
Blaðsíða 71
Blaðsíða 72
Blaðsíða 73
Blaðsíða 74
Blaðsíða 75
Blaðsíða 76

x

Náttúrufræðingurinn

Beinir tenglar

Ef þú vilt tengja á þennan titil, vinsamlegast notaðu þessa tengla:

Tengja á þennan titil: Náttúrufræðingurinn
https://timarit.is/publication/337

Tengja á þetta tölublað:

Tengja á þessa síðu:

Tengja á þessa grein:

Vinsamlegast ekki tengja beint á myndir eða PDF skjöl á Tímarit.is þar sem slíkar slóðir geta breyst án fyrirvara. Notið slóðirnar hér fyrir ofan til að tengja á vefinn.