Bændablaðið - 28.05.2015, Blaðsíða 42

Bændablaðið - 28.05.2015, Blaðsíða 42
42 Bændablaðið | Fimmtudagur 28. maí 2015 Ráðgjafarmiðstöð landbúnaðarins Jón Viðar Jónmundsson Ráðunautur hjá RML jvj@bondi.isNokkur orð um úrval út frá erfðamengi hjá nautgripum Á síðustu árum hefur orðið bylting í framkvæmd á kynbótastarfi í flestum löndum þó að hún hafi farið hjá garði hér á landi. Fari sem mér sýnist þá er hér enn stórfelldari bylting en var um miðja síðustu öld þegar sæðingar og afkvæmarannsóknir nauta ollu umskiptum í framkvæmd nautgriparæktarstarfs. Hér á ég við ræktun byggða á úrvali út frá erfðamengi (genomic selection). Muni ég rétt gerði ég smá grein fyrir þessu hér í blaðinu fyrir nokkrum árum og reyndi að útskýra um hvað væri að ræða. Þá var þetta enn nánast á fræðigrunni en nautastöðvar erlendis samt að byrja að nýta tæknina. Nýverið bar hins vegar fyrir augu mér fyrstu tölur frá Bandaríkjunum sem sýna hverri umbyltingu þetta hefur þegar valdið í ræktunarstarfinu vestanhafs. Þar kemur fram að hjá svartskjöldóttu kúnum hefur erfðagreindum nautum fjölgað úr innan við 9000 árið 2008 í um 17500 árið 2013, en miklu meiri breytingin er hjá kúnum þar sem greiningum fjölgaði á sama tíma úr tæplega 3000 í 125000. Þessum aðferðum er einnig beitt í Jersey kúm og Brúnum svissneskum en ekki í öðrum kúafærri kynjum þar í landi. Á mynd er sýnd hvernig gæði nautanna sem hafa komið í notkun á aðeins lengra tímabili hafa þróast. Þetta er byggt á BLUP mati og því birta þeir þetta með fyrirvara vegna þess að val byggt á erfðamengi rústar í raun ákveðnum grunnforsendum þeirra útreikninga. Framfarirnar eru samt gífurlegar. Það sem er kallað „virði“ er í raun hliðstæða við heildareinkunn eins og við þekkjum hana. Það áhugaverða þarna er að framfarir virðast heldur meiri fyrir hreysti- og meðferðaeiginleikana en mjólkurmarnið. Bylting í verki birtist samt fyrst í þegar skoðaðar eru nokkrar aldurstölur fyrir sæðinganautin bandarísku og þar eru með naut af öllum kynjum einnig nokkrum kynjum sem ekki eiga möguleika til að beita þessari aðferð. Fyrir aldur nautanna þegar þau koma til fyrstu notkunar eru sáralitlar breytingar, aldur þeirra er um 16 mánuðir. Byltingin sést hins vegar þegar farið er að skoða ættliðabilið, þ.e. aldur foreldranna þegar nautið fæðist. Þegar föðurhliðin er skoðuð þá hefur aldurinn færst úr um sjö árum í 3,6, þarna er stærstur hluti byltingarinnar. Á móðurhliðina er einnig umtalsverð breyting eða úr 4,5 árum í 3,2. Nú ætla ég að stökkva aðeins með lesendur og setja tölur aðeins í okkar íslenska samhengi áður en áfram er haldið. Ættliðabilið hjá íslenskum nautum Ég gerði til að fá sambærilegar tölur fyrir okkar nautgriparækt að taka saman hliðstæðar tölur um ættliðabil íslensku nautanna á hluta þessa tímabils, valdi nautin fædd 2009–2013. Ég leyfði mér að reikna ættliðabil einstaklinga aðeins í heilum árum og held það skekki niðurstöður sáralítið. Niðurstöðurnar er að sjá í töflu og tveim stöplaritum og er hér um það einfalda hluti að ræða að þeir skýra sig nánast sjálfir. Hins vegar gefa niðurstöðurnar ef til vill tilefni til örstuttra hugleiðinga. Þegar við skoðum ættliðabilið á föðurhliðina þá er það langt hjá okkur í samanburði við aðra. Þegar við Magnús B. settum upp kynbótaskipulag fyrir kúastofninn fyrir rúmum fjórum áratugum þá gerðum við ráð fyrir að það væri 7 ár. Talsvert vantar á að það náist. Við virðumst standa jafnfætis öðrum hvenær ungnaut komast til notkunar þannig að breytingar þurfa að verða frá hinni hliðinni. Möguleikar á að hraða mati nautanna er einhverjir. Helst kemur mér í hug að strax og einhverjir nýir toppar virtust í sjónmáli væri farið að nota 100–200 skammta úr þeim í valdar kýr og þar ætti ef til vill öðru fremur að velja úrvalsættaðar kvígur. Á móðurhliðina erum við sömuleiðis eftirbátar annarra. Í þeim efnum hefur samt mikið breyst frá því Magnús B. Jónsson skoðað þetta fyrst fyrir nær fimm áratugum en hann fann að á þeim tíma voru nautin ekki valin að jafnaði til ásetnings fyrr en mæður þeirra höfðu skilað sex mjólkurskeiðum. Tvö atrið vil ég hér nefna. Þeirri óheillaþróun sem var í gangi á síðustu áratugum síðustu aldar að kvígurnar urðu eldri og eldri við fyrsta burð verður að snúa enn rækilegar til baka en þegar hefur verið gert. Auk þess sem það er lykilatriði til að auka enn hagkvæmni í mjólkurframleiðslunni. Hitt er það sem ég byrjaði að vekja athygli á og hvetja til fyrir nær þrem áratugum að velja talsverðan hluta nautanna hverju sinni undan úrvalsættuðum kvígum við þeirra fyrsta burð. Í framkvæmd ætti þetta samt að vera enn auðveldara en áður var eftir að farið er að gera kálfana mun eldri þegar þeir eru teknir til einangrunar. Ekki verður séð að neitt marktækt hafi gerst í þessum efnum. Reynslan hefur til viðbótar sýnt að ekki koma síðri naut til notkunar með slíku vali en þegar mæðurnar eru orðnar eldri. Hverju hefur valið út frá erfðamengi breytt? Þegar við sjáum þessar bandarísku tölur þá eru þetta byltingakenndar breytingar. Það sem hefur gerst er að þeir eru að verulegum hluta að leggja niður afkvæmarannsóknir á nautunum og færa alla notkun yfir á ung naut valin út frá erfðamengi. Mér er ekki ljóst hvort slík þróun er byrjuð í Evrópu en það mun gerast mjög bráðlega. Val nautsmæðranna er að verða eingöngu út frá erfðamengi. Það þýðir enn meiri áherslu á nautaval undan fyrsta kálfs kvígum. Þær er mögulegt að erfðagreina strax sem ungkálfa og skipuleggja enn betur en áður framkvæmd alla við val þeirra. Rifjum snögglega upp hvernig erfðaframfarir verða til. Eðlilegast er að mæla þær í árlegri framför og ræðst hún af margfeldi úrvalsstyrks og öryggis í úrvali og síðan er tímareimin í kerfinu ættliðabilið sem við deilum í áðurnefnt margfeldi. Úrvalsstyrkur breytist í raun hverfandi lítið með að taka upp úrval út frá erfðamengi. Við þurfum svipaðan fjölda gripa til viðhalds stofninum jafnvel virðist mér sem sumir geri ráð fyrir fremur fleiri nautum og ástæðum þess verður síðar vikið að. Öryggi í valinu breytist. Þegar afkvæmarannsóknir eru aflagðar þá lækkar eitthvað öryggi í vali nautsfeðranna en hins vegar hækkar það umtalsvert fyrir kýrnar og þá ekki hvað síst fyrir eiginleika með lágt argengi. Enn einn þáttur bætist hins vegar við öryggið. Í núverandi vali hjá okkur er val ásetningskálfanna eingöngu ætternisval og þannig meðaltal af föður- og móðurhliðinni. Það sem breytist þegar farið er að velja út frá erfðamengi er að nú getur þú talsvert ráðið í það hvort það voru góðu eða slæmu erfðavísarnir sem komu frá föður og móður gripsins. Þarna færðu verulegar viðbótaupplýsingar sem ekki eru fyrir í núverandi vali og skipta meginmáli. Mestu áhrifin koma síðan frá tölunum sem við vorum að skoða, ættliðabilinu, sem margfaldar hraða breytinganna. Í heild þýðir þetta aftur á móti að áhættan í ræktunarstarfinu eykst eitthvað, smávegis fjölgun nautanna getur stundum verið þáttur í því að draga úr áhættu. Eitt af því sem nokkuð má sjá rætt í erlendum búfjárritum er að með þessum breytingum sé á vissan hátt verið að færa nautgripakynbæturnar nær því sem gerist í hænsnum og svínum. Ræktunarstarfið alþjóðavæðist. Hinar stóru sæðingarstöðvar erlendis eru að hætta að tala um einhver ákveðin naut. Í stað þess eru vörumerkin ákveðnir eiginleikar. Þú sem viðskiptavinur pantar sæði með sem bestum eiginleikum fyrir þennan eða hinn eiginleikan, ekki tiltekið naut. Nautin í notkun eru flokkuð eftir þessu í notkunarflokka hverju sinni, ekki skiptir öllu máli hvaða naut er notað nema þá með tilliti til skyldleika. Getum við yfirfært þessa tækni? Svarið er einfaldlega nei, það er ekki mögulegt við núverandi þróunarstig tækninnar. Meginskýringin er sú að kúastofninn er of lítill til að mögulegt sé að byggja upp það öryggi í erfðamengisvali sem hægt sé að sætta sig við. Erfðamengisvalið byggir á samtenginu svipfarsupplýsinga og aflestrar erfðagreiningarinnar. Til þess eru notuð tölfræðilíkön sem öðru fremur krefjast feikilega mikils gagnamagns. Það mikils að þau geta aldrei orðið til í okkar litla stofni. Erlendis eru gríðarmiklar rannsóknir á möguleikum þess að nýta upplýsingar frá öðrum kynjum til þess enn að auka öryggi í úrvali. Einstaka sinnum hafa menn náð smávegis árangri í þessum efnum en miklu oftar að það skilar engu. Þróaðar hafa verið kenningar um líkur þess að finna slík sambönd. Í þeim efnum hefur farið fremstur Ástralinn, Goddard, sem í dag er einn þekktasta kynbótafræðingur í nautgriparækt og einn grunnfræðimanna í sambandi við val á grunni erfðamengis. Þær reikniformúlur sem hann hefur þróað hafa sem grunnstærð tímabilið frá því að erfðatengsl frá einu kyni til annars rofnuðu. Samkvæmt þeim virðist mér að mörgum tugum líklegra sé að erlendis takist að finna einhver slík tengsl milli holdanauta og mjólkurkúa en líkur þess að okkur takist að finna slíkar tengingar við erlend mjólkurkúakyn. Ekki bæta þær fréttir stöðu okkar. Hvað getum við gert? Í ljósi þess sem að framan er rakið held ég að verði að meta það hvort menn í alvöru meti skinsamlega möguleika á því að halda áfram kynbótum í íslenska kúastofninum einangruðum eins og verið hefur í yfir 100 ár. Velji menn að hverfa frá því og flytja inn erfðaefni treysti ég mér ekki til að meta að hve miklu leyti menn færu að nýta möguleika erfðatækninnar. Augljóst er hins vegar að árangurinn erlendis á síðasta áratug mundi fylgja með í kaupbæti. Blöndum kynja sem augljóslega fylgir slíkum innflutningi bíður að vísu heim ákaflega spennandi nýtingu erfðatækninnar. Velji bændur hins vegar að halda áfram ræktun íslensku kúnna í einangrun frá öðrum kúakynjum er ég sannfærður um að brýn nauðsyn er til að skoða alla þá möguleika sem hin nýja tækni býður. Ein varnaðarorð vil ég samt strax viðhafa. Hér er farið yfir í að nýta tækni sem er kostnaðarsöm í samanburði við flest sem notað hefur á því sviði hingað til. Þess vegna er nauðsynlegt að öll verkefni á þessu sviði sé skipulögð af sem bestu viti. Menn hafa einfaldlega ekki efni á að sóa fjármunum í eitthvert rugl á þessu sviði sem frá upphafi má vera ljóst að engu skilar. Af hlutum sem mundu koma að umtalsverðu gagni í lokuðum stofni má benda á mat á raunverulegri skyldleikarækt einstaklinga. Með að geta greint erfðaefni frá hvoru foreldri er mögulegt að meta þetta mun nákvæmar en að reikna út frá ætternisupplýsingum. Afkvæmi hálfsystkina geta verið að dreifast á allt bilið frá að vera með öllu óskyld yfir í skyldleika afkvæma alsystkina þó að við reiknum þau öll jafnskyld út frá ætternisupplýsingum. Slíkt fer að verða brýnt í litlum stofni sem fer að komast á það stig sem mér sýnist íslensku stofninn núna. Mögulegt er að sérstakar samsætur megi finna í íslenska stofninum, stórvirka erfðavísa trúi ég ekki mikið á, þá værum við búin að finna væru þeir fyrir hendi, svo ruglaðir höfum við fjandakornið ekki verið. Hugmyndina um sérstakar samsætur hafa ákveðinn stuðning úr rannsóknum Braga og Emmu á mjólkurpróteinum fyrir um áratug. Ég vil ljúka þessum sundurlausu punktum með því að segja að eitt mesta framlag rannsókna á vali út frá erfðamengi er að endanlegar sönnur eru komnar á það að mest af eldsneytinu sem við höfum til að vinna með í ræktunarstarfinu fyrir nær alla mikilvæga eiginleika eru lítil áhrif hvers einstaks erfðavísis en þeir eru í hundraðatali oft að baki einstökum eiginleika og þess vegna er erfðabreytileikinn ákaflega dýrmæt auðlind fyrir komandi kynslóðir manna og dýra. 0 10 20 30 40 50 6 7 8 9 10 11 12 Fö ld ij Aldur ár Aldur feðra 0 5 10 15 20 25 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12Aldur móður Fj öl di Aldur mæðra Þróun erfðaeðlis bandarískra nauta fyrir annars vegar mjólkurmagn og hins vegar heildareinkunn á síðustu árum. Aldur mæðra nautanna fæddra frá 2009 til 2012 sem komu til notkunar á Nautastöð BÍ. Aldur feðra nautanna fæddra frá 2009 til 2012 sem komu til notkunar á Nautastöð BÍ.
Blaðsíða 1
Blaðsíða 2
Blaðsíða 3
Blaðsíða 4
Blaðsíða 5
Blaðsíða 6
Blaðsíða 7
Blaðsíða 8
Blaðsíða 9
Blaðsíða 10
Blaðsíða 11
Blaðsíða 12
Blaðsíða 13
Blaðsíða 14
Blaðsíða 15
Blaðsíða 16
Blaðsíða 17
Blaðsíða 18
Blaðsíða 19
Blaðsíða 20
Blaðsíða 21
Blaðsíða 22
Blaðsíða 23
Blaðsíða 24
Blaðsíða 25
Blaðsíða 26
Blaðsíða 27
Blaðsíða 28
Blaðsíða 29
Blaðsíða 30
Blaðsíða 31
Blaðsíða 32
Blaðsíða 33
Blaðsíða 34
Blaðsíða 35
Blaðsíða 36
Blaðsíða 37
Blaðsíða 38
Blaðsíða 39
Blaðsíða 40
Blaðsíða 41
Blaðsíða 42
Blaðsíða 43
Blaðsíða 44
Blaðsíða 45
Blaðsíða 46
Blaðsíða 47
Blaðsíða 48
Blaðsíða 49
Blaðsíða 50
Blaðsíða 51
Blaðsíða 52
Blaðsíða 53
Blaðsíða 54
Blaðsíða 55
Blaðsíða 56
Blaðsíða 57
Blaðsíða 58
Blaðsíða 59
Blaðsíða 60
Blaðsíða 61
Blaðsíða 62
Blaðsíða 63
Blaðsíða 64

x

Bændablaðið

Beinir tenglar

Ef þú vilt tengja á þennan titil, vinsamlegast notaðu þessa tengla:

Tengja á þennan titil: Bændablaðið
https://timarit.is/publication/906

Tengja á þetta tölublað:

Tengja á þessa síðu:

Tengja á þessa grein:

Vinsamlegast ekki tengja beint á myndir eða PDF skjöl á Tímarit.is þar sem slíkar slóðir geta breyst án fyrirvara. Notið slóðirnar hér fyrir ofan til að tengja á vefinn.