Náttúrufræðingurinn

Árgangur
Tölublað

Náttúrufræðingurinn - 2023, Blaðsíða 39

Náttúrufræðingurinn - 2023, Blaðsíða 39
ɑ2 keðju. Kollagenið COL1 er algeng- ast í beinum og þar finnst um 80% af öllum próteinum. Aðferðin við að greina tegundar- einkenni kollagena byggir á nokkrum skrefum. Fyrst er kollagenið einangrað úr beinasýnunum. Síðan er það klippt niður í einingar með meltingarensími (próteasa), yfirleitt trypsíni sem klýfur C-enda peptíð-tengja hjá tveimur amínósýrum, arginíni (R) og lýsini (K). Þá er vatnssameindum bætt við hvert peptíð. Við þetta verður til safn af kollagen-peptíðum sem eru breyti- leg að lengd og þyngd en samsetning þeirra fer eftir tegundum. Þá er sýru- stig peptíðlausnanna lækkað, peptíðin hreinsuð með síun og dreifð á sér- staka plötu MALDI (e. Matrix-Assi- sted Laser Desorption/Ionization) með neti (e. matrix) sem bindur peptíðin. Platan er síðan geisluð með leysigeisla sem hefur þau áhrif að peptíðin fá +1 hleðslu og verða að jónum. Rafsviði er beitt á jónirnar í sérstöku röri, eða TOF (e. Time-Of-Flight mass spectrometer), og færast jónirnar mishratt eftir þyngd í rörinu. Léttustu peptíðin ná ákveðnum skynjara fyrst en þau þyngstu síðast. Við þetta fæst massaróf (e. mass spectrum) fyrir peptíðin sem er síðan staðlað fyrir hvert sýni í svokallað massahleðsluhlut- fall (m/z). Hver stærðarbútur myndar toppa á rófinu sem síðan má bera saman við massaróf af þekktum tegundum og ákvarða þannig úr hvaða tegund sýnin koma. Nánari lýsingu á kollagengrein- ingaraðferðinni og notkun hennar til tegundagreiningar má finna í yfirlits- grein Richter o.fl.12 Tveir af toppum á massarófi kolla- gena eru ólíkir í steypireyðum og lang- reyðum. Stærðarbútur númer COL1ɑ- 2-502 er 1550,8 m/z hjá steypireyðum en 1566,8 m/z í langreyðum. Bútur númer COL1ɑ2-793 er 2105,1 m/z meðal steypireyða en 2135,1 m/z hjá lang- reyðum. Aðrar tegundir hvala hafa enn ólíkara massaróf. ÁNASTAÐAHVALIRNIR Sýni Í garðinum að Ytri-Ánastöðum á Vatns- nesi er enn að finna bein úr hvölunum sem festust í ís og voru skornir 1882 (2. mynd). Á sínum tíma höfðu beinin verið tekin heim úr hvalfjörunni neðan við bæinn (Guðmundur Jónsson munnl. uppl.). Þann 21. maí 2021 fór annar höfunda (ÆP) og Ragnar Helgi Ólafs- son í fylgd Guðmundar Jónssonar sem er ættaður frá Ytri-Ánastöðum og tóku svarfsýni úr beinunum til greiningar. Alls voru tekin fimm sýni en þau voru úr tveimur hryggjarliðum, einu rifi og einum þvertind hryggjarliðar. Sýni þessi voru send til greiningar hjá BioArCh, efnafræðistofu fornleifafræðideildar Há- skólans í York á Englandi, í október 2022 og bárust niðurstöður um mánuði síðar sem telja má snögga afgreiðslu. Niðurstöður Massagreining á öllum fimm beinasýn- unum frá Ánastöðum leiddi í ljós hlut- fall massahleðslu fyrir 10 prótínbúta úr COL1ɑ1 og COL1ɑ2. Bútarnir sem greina milli steypireyða og langreyða (COL1ɑ2 502 og COL1ɑ2 793) reyndust allir vera með hlutföllin 1550,8 m/z og 2105,1 m/z. Engir bútar greindust með hlutföllin 1566,8 m/z eða 2135,1 m/z sem eru einkennandi fyrir langreyðar. Steypireyðar og langreyðar eru skyldar tegundir og hafa nokkrir kynblendingar milli tegundanna fundist hér við land samkvæmt DNA-greiningu, þar sem hlutar af erfðaefni tegundanna hefur borist á milli þeirra.13,14 2. mynd. Bein úr hvölunum sem lokuðust inni í ís við Ánastaði á Vatnsnesi vorið 1882. Ragnar Helgi Ólafsson (t.h.) og Guðmundur Jónsson (t.v.) standa hjá beinunum í garðinum að Ytri-Ána- stöðum. – Bones of the whales ice-locked at the beach at the farm Ánastaðir (N-Iceland) in spring 1882. Ragnar Helgi Ólafsson and Guðmundur Jónsson assisted with sampling. (Ljósm./ photo. Ævar Petersen, 21.05.2021. 127 Ritrýnd grein / Peer reviewed
Blaðsíða 1
Blaðsíða 2
Blaðsíða 3
Blaðsíða 4
Blaðsíða 5
Blaðsíða 6
Blaðsíða 7
Blaðsíða 8
Blaðsíða 9
Blaðsíða 10
Blaðsíða 11
Blaðsíða 12
Blaðsíða 13
Blaðsíða 14
Blaðsíða 15
Blaðsíða 16
Blaðsíða 17
Blaðsíða 18
Blaðsíða 19
Blaðsíða 20
Blaðsíða 21
Blaðsíða 22
Blaðsíða 23
Blaðsíða 24
Blaðsíða 25
Blaðsíða 26
Blaðsíða 27
Blaðsíða 28
Blaðsíða 29
Blaðsíða 30
Blaðsíða 31
Blaðsíða 32
Blaðsíða 33
Blaðsíða 34
Blaðsíða 35
Blaðsíða 36
Blaðsíða 37
Blaðsíða 38
Blaðsíða 39
Blaðsíða 40
Blaðsíða 41
Blaðsíða 42
Blaðsíða 43
Blaðsíða 44
Blaðsíða 45
Blaðsíða 46
Blaðsíða 47
Blaðsíða 48
Blaðsíða 49
Blaðsíða 50
Blaðsíða 51
Blaðsíða 52
Blaðsíða 53
Blaðsíða 54
Blaðsíða 55
Blaðsíða 56
Blaðsíða 57
Blaðsíða 58
Blaðsíða 59
Blaðsíða 60
Blaðsíða 61
Blaðsíða 62
Blaðsíða 63
Blaðsíða 64
Blaðsíða 65
Blaðsíða 66
Blaðsíða 67
Blaðsíða 68
Blaðsíða 69
Blaðsíða 70
Blaðsíða 71
Blaðsíða 72
Blaðsíða 73
Blaðsíða 74
Blaðsíða 75
Blaðsíða 76
Blaðsíða 77
Blaðsíða 78
Blaðsíða 79
Blaðsíða 80

x

Náttúrufræðingurinn

Undirtitill:
alþýðlegt fræðslurit um náttúrufræði
Gerð af titli:
Flokkur:
Gegnir:
ISSN:
0028-0550
Tungumál:
Árgangar:
92
Fjöldi tölublaða/hefta:
295
Skráðar greinar:
Gefið út:
1931-í dag
Myndað til:
2023
Útgáfustaðir:
Efnisorð:
Lýsing:
Náttúrufræði.
Styrktaraðili:

Beinir tenglar

Ef þú vilt tengja á þennan titil, vinsamlegast notaðu þessa tengla:

Tengja á þennan titil: Náttúrufræðingurinn
https://timarit.is/publication/337

Tengja á þetta tölublað: 3.-4. tölublað (2023)
https://timarit.is/issue/435849

Tengja á þessa síðu:

Tengja á þessa grein:

Vinsamlegast ekki tengja beint á myndir eða PDF skjöl á Tímarit.is þar sem slíkar slóðir geta breyst án fyrirvara. Notið slóðirnar hér fyrir ofan til að tengja á vefinn.

3.-4. tölublað (2023)

Aðgerðir: